<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Dear EEGlab. </p>
<p>For data rank reasons, I interpolated and average referenced after ICA, using runica. When re-referencing I deleted the ICA activation matrix and the ICA weights, because of course I now have interpolated channels which do not have ICA weights associated
 with them.</p>
<p><br>
</p>
<p>I only wanted to do ICA for eye blink rejection, and it worked perfectly and I did not have any ICA corruption (trade offs or rank deficiency). I compared the data before and after ICA and the level of noise was the same. </p>
<p><br>
</p>
<p>I am working with an extremely large dataset and do not ideally want to re-do these steps, especially because I am mainly working with raw channel ERP data. </p>
<p><br>
</p>
<p>However, for future analysis, if I did want to work with component data, could I re-run ICA for a second time, this time on the Chanel data where ICA blink components have been removed, and where the interpolated electrodes and the new reference implemented (this
 data should already be clean from blinks etc).</p>
<p><br>
</p>
<p>Overal this would look like:</p>
<p><br>
</p>
<p>Identify noisy channels</p>
<p>Run ICA on clean channels </p>
<p>Interpolate electrodes to give the same 60 electrodes per person</p>
<p>Average reference to the 60 electrodes</p>
<p>Compute ERPs on channel data</p>
<p>Then re-run ICA, and do any further analysis on component data. </p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Please let me know if you can see any issues with this. I very much appreciate any advice. </p>
<p>Best wishes,</p>
<p>Jumana </p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p></p>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b>------------------------------------------</b></span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b><span style="background-color:rgb(255,238,148)">Jumana
 Ahmad</span></b></span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt">Post-Doctoral Research Worker in Cognitive Neuroscience </span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><i>EU-AIMS Longitudinal European Autism Project (LEAP)
 & SynaG Study</i></span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt">Room M1.26.Department of Forensic and Neurodevelopmental
 Sciences (PO 23) | Institute of Psychiatry, Psychology & Neuroscience | King’s College London | 16 De Crespigny Park | London SE5 8AF</span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> </span></font></span></font></div>
<div style="color:rgb(0,0,0); font-family:Helvetica; margin:0px"><font face="Calibri,sans-serif" size="2"><span style="font-size:11pt"><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b>Phone:</b></span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> 0207
 848 5359| </span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b>Email:</b></span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> <span style="background-color:rgb(255,238,148)">jumana.ahmad</span></span></font><a href="mailto:antonia.sanjose@kcl.ac.uk" target="_blank" id="LPNoLP"><font size="2" color="purple"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt">@kcl.ac.uk</span></font></a><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> | </span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b>Website:</b></span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> </span></font><a href="http://www.eu-aims.eu/" target="_blank" id="LPNoLP"><font size="2" color="purple"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt">www.eu-aims.eu</span></font></a><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> | </span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"><b>Facebook:</b></span></font><font size="2" color="#1F497D"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt"> </span></font><a href="http://www.facebook.com/euaims" target="_blank" id="LPNoLP"><font size="2" color="purple"><span lang="en-GB" style="font-size:10pt">www.facebook.com/euaims</span></font></a></span></font></div>
<br>
<p></p>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>