<div dir="ltr">Dear Martin,<div><br></div><div><span style="font-family:calibri,sans-serif;font-size:14.6667px">> After I run ICA, does the structure EEG.data contains the components transformed in channel-by-times?</span><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">EEG.data is a channel x time structure. EEG.icaact is IC x time structure. They have the same length. EEG.data remains the same before and after ICA calculation.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Feb 10, 2017 at 7:30 AM, Martin Simoneau <span dir="ltr"><<a href="mailto:Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca" target="_blank">Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">





<div lang="FR">
<div class="gmail-m_-2919061872090532114WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">Dear Makoto,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">Thanks for your answer.
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">After I run ICA, does the structure EEG.data contains the components transformed in channel-by-times?
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">If not, how can I transform back the components in channel-by-time series?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">Regards,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">Martin<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif">De :</span></b><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif"> Makoto Miyakoshi [mailto:<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>]
<br>
<b>Envoyé :</b> jeudi 9 février 2017 22:42<br>
<b>À :</b> Martin Simoneau <<a href="mailto:Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca" target="_blank">Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca</a><wbr>><br>
<b>Cc :</b> <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br>
<b>Objet :</b> Re: [Eeglablist] Does EEG.icaact represent components in channel reference?<u></u><u></u></span></p><div><div class="gmail-h5">
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Dear Martin,<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">> As a result, if row 20 in EEG.data represents C3, analysing row 20 in EEG.icaact is analysing C3, am I right?<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">No. Channels and ICs are related via weight matrix. It's not one to one!<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">> In other words, if I remove components, it is possible that C3 is no longer present. <u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">No. When you remove IC20, then the backprojection of the remaining ICs will miss contribution by IC20.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Makoto<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">On Tue, Feb 7, 2017 at 1:08 PM, Martin Simoneau <<a href="mailto:Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca" target="_blank">Martin.Simoneau@kin.ulaval.ca</a><wbr>> wrote:<u></u><u></u></p>
<blockquote style="border-style:none none none solid;border-top-width:initial;border-right-width:initial;border-bottom-width:initial;border-top-color:initial;border-right-color:initial;border-bottom-color:initial;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-width:1pt;padding:0cm 0cm 0cm 6pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0cm">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">Hi everyone,</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">I have questions regarding this sentence: “the components were transformed back to the channel-by-time series.” From my understanding, the authors ran ICA on
 their EEG channels. Thereafter, transformed back to the channel time-series meant that they used EEG.icaact to analyse their time-series in EEG channel reference. Therefore, the time-series in EEG.icaact are the components in the channel reference, am I right?
</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">As a result, if row 20 in EEG.data represents C3, analysing row 20 in EEG.icaact is analysing C3, am I right?
</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">However, if I remove components because some showed eye blink or other artefact, now EEG.icaact has less row than EEG.data. How can I find C3 after removing components?</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">In other words, if I remove components, it is possible that C3 is no longer present. Can I transform components back in channel-by-time series without losing
 some channels after removing components?</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"> </span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">Thanks for your help,</span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="color:rgb(136,136,136)"> </span><span style="color:rgb(136,136,136)"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="color:rgb(136,136,136)">Martin</span><span style="color:rgb(136,136,136)"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="color:rgb(136,136,136)"> </span><span style="color:rgb(136,136,136)"><u></u><u></u></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/<wbr>eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.<wbr>ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.<wbr>edu</a><u></u><u></u></p>
</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
<br clear="all">
<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal">-- <u></u><u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<u></u><u></u></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>