<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:#333399">Hello Jose a few extra notes below, best wishes.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">you might need some matlab expertise to do this right via script, as eeglab usually or always needs epochs to be of the same length for analyses within eeglab. It is unlikely that eeglab functions handle variable length epochs.I recommend selecting a common time period from marker A to as close as you can to marker C, or having two kinds of epochs, one starting from Marker A, and another going backward from marker C, but using similar length time period. At least like this you could examine effects mainly after marker A, and mainly before marker C, and perhaps even constrast the conditions. There may be recent changes in the new eeglab, please review the updates on changes made in it. </div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Mar 4, 2017 at 6:48 PM, José Luis <span dir="ltr"><<a href="mailto:joseluisulloafulgeri@gmail.com" target="_blank">joseluisulloafulgeri@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi,<div>I'm sorry my question was not enough clear,</div><div>I don't need to add another marker based on two previous markers. I need to epoch my data based in two markers because my period of interest is between a given marker A and another marker C and this interval of time is variable,</div><div>I have tried to found other related threads in the EEGlab list but the last one was on 2013, and apparently there was no way to do it, I wanted to know if someone has implemented this by now,</div><div><br></div><div>thanks,</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 5 March 2017 at 00:02, Tarik S Bel-Bahar <span dir="ltr"><<a href="mailto:tarikbelbahar@gmail.com" target="_blank">tarikbelbahar@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:#333399">Hello Jose, yes use addnewevents ? function mentioned in eeglablist.Use a matlab loop to make a new list of events based on the events you have already. Then epoch on the new events you've made.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">also several past eeglablist emails exist about making lists of new events and importing them</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div></div><div class="m_9092704039993981136HOEnZb"><div class="m_9092704039993981136h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Mar 4, 2017 at 4:54 PM, José Luis <span dir="ltr"><<a href="mailto:joseluisulloafulgeri@gmail.com" target="_blank">joseluisulloafulgeri@gmail.co<wbr>m</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Tarik,<div><br></div><div>Thanks for the input,</div><div>Looks the approach we are taking is good,</div><div>However, I haven't be able to epoch using two triggers, I need to select an epoch which is 0.5 sec before a trigger A, and 0.5 sec after a trigger D, is there any way to do this?,</div><div><br></div><div>thanks for your help,</div><div>best</div><div>Jose</div><div><div class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875h5"><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 3 March 2017 at 21:25, Tarik S Bel-Bahar <span dir="ltr"><<a href="mailto:tarikbelbahar@gmail.com" target="_blank">tarikbelbahar@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:#333399">Hello Jose,</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">Yes you should be able to re-epoch, then run ICA on just the epochs without the buffer time,</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">and then re-apply the ICA results to the files with the buffer time, and go from there.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">You may have to insert a new trigger, but you should be able to just "select an epoch start/end time that does include the buffer times. First try it with one file from the gui, and use eegh to build a script for that.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">Overall, if your buffer time is under ~2 seconds, and has no large artifacts, it would be okay to include them in the ICA. In other words, your ICA results should look very similar with either method (with or without the buffer periods).</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">Check Makoto's general recommendations for ICA just in case, if you haven't had a chance to.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div><div class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875m_-2707548039398272146m_-6852098896220450177h5">On Fri, Mar 3, 2017 at 10:11 AM, José Luis <span dir="ltr"><<a href="mailto:joseluisulloafulgeri@gmail.com" target="_blank">joseluisulloafulgeri@gmail.co<wbr>m</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875m_-2707548039398272146m_-6852098896220450177h5"><div dir="ltr">hi,<div><br></div><div>I'm analysing EEG data and want to perform ERP and time-frequency analyses,</div><div>I'm doing the pre-processing with EEGlab,</div><div>I wanted to move fast so I epoch my data and then I proceed with the artefact rejection. I epoch my data taken into consideration that for time-frequency I need a buffer zone,</div><div>Now, I want to perform ICA but only in a selected time period of interest. I have several question here:<br></div><div>1) Can I do ICA in select periods of time within my epochs?</div><div>2) If not, I could try to re-epoch my dataset, perform ICA in the re-epoched (shorter) dataset, and then re-inject the weight of the ICA back to the original dataset), does that sound ok? I'm only interested in my selected time period of interest, and the rest of the signal I would use it because I need a buffer zone, and because long periods to compute power at low frequencies,</div><div>3) Can I epoch relative to two triggers, i.e. for a sequence of triggers: A, B, C, D, E I want to do from -0.5 relative to A until E,</div><div><br></div><div>Thanks in advance for your help,</div><div>Jose<span class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875m_-2707548039398272146m_-6852098896220450177m_2888107400587589046m_-3716522886377146035HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875m_-2707548039398272146m_-6852098896220450177m_2888107400587589046m_-3716522886377146035m_3632797050585802954gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">José Luis ULLOA FULGERI, PhD<br><span><a href="tel:+32%20477%2042%2090%2007" value="+32477429007" target="_blank">+32477429007</a><br>+32<span>4</span>92646477</span><br><a href="https://sites.google.com/site/joseluisulloafulgeri/" target="_blank">https://sites.google.com/site/<wbr>joseluisulloafulgeri/</a><br><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"><span style="font-family:tahoma,sans-serif"><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"></span></span></span></span></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</font></span></div>
</div>
<br></div></div>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><br></blockquote></div><br></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_9092704039993981136m_7368262174209437875m_-2707548039398272146m_-6852098896220450177gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">José Luis ULLOA FULGERI, PhD<br><span><a href="tel:+32%20477%2042%2090%2007" value="+32477429007" target="_blank">+32477429007</a><br>+32<span>4</span>92646477</span><br><a href="https://sites.google.com/site/joseluisulloafulgeri/" target="_blank">https://sites.google.com/site/<wbr>joseluisulloafulgeri/</a><br><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"><span style="font-family:tahoma,sans-serif"><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"></span></span></span></span></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_9092704039993981136gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">José Luis ULLOA FULGERI, PhD<br><span><a href="tel:+32%20477%2042%2090%2007" value="+32477429007" target="_blank">+32477429007</a><br>+32<span>4</span>92646477</span><br><a href="https://sites.google.com/site/joseluisulloafulgeri/" target="_blank">https://sites.google.com/site/<wbr>joseluisulloafulgeri/</a><br><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"><span style="font-family:tahoma,sans-serif"><span style="border-collapse:separate;color:rgb(102,102,102);font-family:'Times New Roman';font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="font-family:arial;font-size:small"></span></span></span></span></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>
</div></div></blockquote></div><br></div>