<div dir="ltr"><p dir="ltr"><span style="color:rgb(0,0,0)">Hello Joshua, a few notes below that might help</span></p><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​. <br><br>If you're interested in baselining, you may want to take a look a how the eeglab baselining function does it. What you're doing seems okay and would occur to all channels and timepoints in the non-baseline period.<br></span></div><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)"><br>​</span></div><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">within eeglab, i</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">Its likely that youre not updating the eeg structure or saving again</span><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​, as this function should have no issues.​</span></div><p></p>
<p dir="ltr"><span style="color:rgb(0,0,0)">If you havent yet, try it first from the gui, then save the dataset via the gui, then check that your data has been baselined</span></p><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​ (or not)​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">, then ty</span><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​p​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">e eegh to review the commands that were run.</span><p></p>
<p dir="ltr"><span style="color:rgb(0,0,0)">Examine the eegh output</span></p><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​. ​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">Try running just bas</span><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​e​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">line function from command line, and the run necessary update to the eeg structure and save the file anew.<br></span>
<div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​<br>i​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">f its still not baselining</span><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​ and updating correctly​</span></div><span style="color:rgb(0,0,0)">, and you can replicate it, please send a note to eeglab bugzill</span><div style="display:inline" class="gmail_default"><span style="color:rgb(0,0,0)">​a, as it would be useful to fix.​</span></div><p></p>
</div>