<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Hello Ranawaz, there should be an easy fix to your problem. Notes below:</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***********************************************************<br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Overall, however, you should try your best to know/check what adjust is doing, although many researchers trust algorithms a lot these days. If you have not had a chance to, I recommend first reviewing the eeglab tutorials, videos, and web pages about ICA and ICA rejection. Overall, unless you have hundreds of ICA decompositions, try using a combination of automatic and human IC selection.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">**</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">This does not seem to be a problem with adjust. It seems to be a problem with your artifacts perhaps not being properly isolate. Make sure you are familiar with what the artifacts look like in the continuous data.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Check that you properly cleaned the data before ICA. See Makoto's pipeline about eeglab steps for some general recommendations for beginning users.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">************</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">*Not all artifactual ICs are removed, it is still an imperfect science.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">*if you are a newbie with ICA, you can train yourself here: <i style="color:rgb(0,0,0);white-space:pre-wrap"><a href="http://reaching.ucsd.edu:8000/">http://reaching.ucsd.edu:8000</a></i></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">This should be a very useful resource for you.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***********</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Also, if you haven't had a chance to, show yourself everything works in your setup by using and removing ICs from the eeglab tutorial datasets.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">**********************************</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">also, check that you are correctly updating the EEG structure and saving to file as necessary, just type eegh to get the commands that are being run when you practice your steps first via the eeglab gui.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***also check you are using recent eeglab update, recent matlab, and recent adjust plugin.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">**see also a wide range of other ICA processing plugins mentioned on eeglablist</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Apr 25, 2017 at 6:34 AM, Rabnawaz khan <span dir="ltr"><<a href="mailto:13mseerabnawaz@seecs.edu.pk" target="_blank">13mseerabnawaz@seecs.edu.pk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><img width="0" height="0" class="m_-6087474111802094733mailtrack-img" style="float:right" alt="" src="https://mailtrack.io/trace/mail/967cd13143d891930c3789fe81e61dc41064a821.png?u=1584927"><span style="font-size:12.8px">Dear All,</span><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I am using ADJUST plugin for artifact removal from raw data. I follow the instruction listed in the ADJUST manual to process the data. after running ADJUST I get the artifacted ICs in a new pop-up window, I mark these ICs for rejection and then I go to tools to remove these ICs (via EEGlab GUI menu>>tools>>remove components). A new dataset is created (eegdata pruned with ICA ), according to ADJUST tutorial this is the clean eeg data, but I see from the plots that there is still artifact present in the data. When I run ICA again and then again run ADJUST I get a new pop-up window in which some other ICs are identified as artifacts. I remove these ICs again. But still, artifact are present in data. I repeat running ADUST many time and each time I get new ICs marked as an artifact. </div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I would be happy if you guide me with this problem. </div><div><div class="m_-6087474111802094733gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font color="#666666"><br></font></div><div dir="ltr"><font color="#666666"><br></font></div><div dir="ltr"><font color="#666666"><br></font></div><div dir="ltr"><font color="#666666">Best Regards,</font><div><br></div><div>Rabnawaz</div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><br><br></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/<wbr>eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.<wbr>ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.<wbr>edu</a><br></blockquote></div><br></div>