<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Thanks Francesca. OK!  Some extra notes below, best wishes.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">************************************************************************</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Whether rejecting entire epochs or smaller periods is up to the researcher & their beliefs/biases/tendencies.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">In your case, the best recommendation is to follow procedures from published articles in high-quality journals using data similar to yours.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Remember ICA in eeglab does not care whether you feed it epochs or continuous data, it mixes up all the timepoints you give it anyway.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">The better question if whether you are feeding ICA the appropriate time periods, and enough of them.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Note that once you have an ICA decompisition, you can do the following which would minimize how many epochs you drop.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">A.Clean your data just taking out the worst periods, as per eeglab tutorials, but without epoching. Use only periods where the experiment was actually happening.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">B. apply the ICA to the continuous original data</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">C. remove bad/artifactual ICs (for example, eye-related and muscle-related ICs)</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">D. then epoch</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">E. Then review the data and drop worst epochs</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">If you epoch from the start of your preprocessing pipeline, then yes, you will be removing more than less of the time points of interest, because one can only select full epochs.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">An Alternative to consider here is to </div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">A. Just take from the beginning of your experimental period to the end of it.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">B. Cut into small epochs (.5 or 1 sec)</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">C. Remove worst of these (fake) epochs</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">D. Run ICA</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><div class="gmail_default">E. apply the ICA to the continuous original data</div><div class="gmail_default">F. remove bad/artifactual ICs (for example, eye-related and muscle-related ICs)</div><div class="gmail_default">G. then epoch</div><div class="gmail_default">H. Then review the data and drop worst epochs</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">It is however important to remember that you want to feed into ICA only the periods of interest. <br></div></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">That is one reason to use epochs, as this will make sure that you only feeding into ICA experimental data, and not data where the person is waiting, doing nothing, or uninteresting "between epoch" pauses.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">************************************************************************<br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div></div>