<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Hello Jaleh, some extra notes for you below. Remember it is generally better to provide more details/pictures/errorInformation for better or more specific answers. Best wishes.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***************************BEGIN EXTRA NOTES FOR JALEH</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Yes, a visual or mathematical analysis of the time course of component activations is possible to use to detect "non-neural" components.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">However, there are multiple features of IC components that should be used. See the eeglab tutorials and other teaching materials on how to select good ICs.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">See also the ICA classification website where you can train yourself how to detect good/bad ICs.  It is developed by eeglab developers, and it also has a feedback option in practice mode that can help you learn. Here is the link, please be sure to check it out before moving forward:   <i style="color:rgb(0,0,0);white-space:pre-wrap"><a href="http://reaching.ucsd.edu:8000">http://reaching.ucsd.edu:8000</a> </i></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Overall, it is important to be able to personally understand how/why some ICs are non-neural. It is important not to be fully dependent on algorithms or plugins (although some existing ICA classification tools are very useful and work well for detecting classic bad ICs)</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">In regards to adjust, if you're having some issues, contact the Adjust team, although the issues may be based on your data rather than adjust. Usually adjust works well.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">I would recommend checking out and also testing the several other plugins for ICA classfication, including SASICA and MARC-ICA and others. </div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">***************************END EXTRA NOTES FOR JALEH<br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Jun 18, 2017 at 9:31 AM, Jaleh Mohammad alipoor <span dir="ltr"><<a href="mailto:sugmad973@yahoo.com" target="_blank">sugmad973@yahoo.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="color:#000;background-color:#fff;font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:13px"><div id="m_-2313607517365199360yui_3_16_0_ym19_1_1497791710970_11228">Oh, l'm so sorry! </div><div dir="ltr" id="m_-2313607517365199360yui_3_16_0_ym19_1_1497791710970_11184">l wanted to say l want to use  "component time course" through "plot>component activations (scroll)" to remove bad components not bad channels. </div><div dir="ltr" id="m_-2313607517365199360yui_3_16_0_ym19_1_1497791710970_11184">now could you please tell me is it possible? because l have some strange problems in running adjust plugin to find artifactual components!</div><div></div><div id="m_-2313607517365199360yui_3_16_0_ym19_1_1497791710970_11066"> </div><div class="m_-2313607517365199360signature" id="m_-2313607517365199360yui_3_16_0_ym19_1_1497791710970_11397">Best regards,<div>Zhaleh </div><div><br></div></div><div><div class="h5"> <div class="m_-2313607517365199360qtdSeparateBR"><br><br></div><div class="m_-2313607517365199360yahoo_quoted" style="display:block"> <div style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:13px"> <div style="font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:16px"> <div dir="ltr"><font size="2" face="Arial"> On Sunday, June 18, 2017 6:06 AM, Tarik S Bel-Bahar <<a href="mailto:tarikbelbahar@gmail.com" target="_blank">tarikbelbahar@gmail.com</a>> wrote:<br></font></div>  <br><br> <div class="m_-2313607517365199360y_msg_container"><div id="m_-2313607517365199360yiv2770853120"><div><div dir="ltr"><font color="#000000"></font><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_default" style="display:inline">​​</div>Hello Jaleh, Notes below<div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_default" style="color:rgb(51,51,153);display:inline">​, </div><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_default" style="color:rgb(51,51,153);display:inline">​</div>best wishes.<div><font color="#000000"><br clear="none"><br clear="none">**BEGIN NOTES*************************<wbr>******************************<wbr>********************<br clear="none"><br clear="none"></font></div><div><font color="#000000">*Since the component plots show ICs looking at their time courses cannot inform you about bad channels, unless, for example, the ICs are very focused on a single channel, or clearly have some bad channels in their scalp map.<br clear="none"><br clear="none">*One can use component-based  artifactual period rejection tools via the eeglab gui (which has multiple kinds of rejection similar to the suite of channel-based artifactual period rejection tools in the gui). Further, it is possible that some of these methods (component-based artifactual time period rejection in the eeglab gui) use the temporal IC course as part of the information.<br clear="none">See the listing of Tools>Reject options at the page describing the eeglab menu options.<br clear="none"><a rel="nofollow" shape="rect" href="https://sccn.ucsd.edu/wiki/EEGLAB_Menu_Functions" target="_blank">https://sccn.ucsd.edu/wiki/<wbr>EEGLAB_Menu_Functions</a><br clear="none"><br clear="none">*One can also check the reconstructed EEG data before and and after removing some components to see which components (when retained), contribute to a noisy channel in the rebuilt EEG data.<br clear="none"><br clear="none">*One could also build a new function to "guess" worst channels based on IC temporal information<br clear="none"><br clear="none"> If you haven't had a chance, please make sure to review the following chapter on the eeglab wiki, which is really useful for new users (along with the other chapters of course! :)<br clear="none"><br clear="none">Chapter 01: Rejecting Artifacts - SCCN<br clear="none"><br clear="none"><a rel="nofollow" shape="rect" href="https://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_01:_Rejecting_Artifacts" target="_blank">https://sccn.ucsd.edu/wiki/<wbr>Chapter_01:_Rejecting_<wbr>Artifacts</a><br clear="none"><br clear="none"></font><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_default" style="display:inline">​</div>**<div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_default" style="display:inline">​END</div> NOTES************************<wbr>******************************<wbr>*********************<br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"><br clear="none"></div><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_extra"><font color="#000000"><br clear="none"></font><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_quote"><font color="#000000">On Sat, Jun 17, 2017 at 6:40 AM, Jaleh Mohammad alipoor <span dir="ltr"><<a rel="nofollow" shape="rect" href="mailto:sugmad973@yahoo.com" target="_blank">sugmad973@yahoo.com</a>></span> wrote:<br clear="none"></font><blockquote class="m_-2313607517365199360yiv2770853120gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120yqt0421103863" id="m_-2313607517365199360yiv2770853120yqt00129"><div><div style="background-color:rgb(255,255,255)"><div id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6427"><span id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6449"><font color="#000000">hello, </font></span></div><div dir="ltr" id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6427"><span id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6451"><font color="#000000">l want to know after running ICA, can l use "component time course" through "plot>component activations (scroll)" to identify and remove bad channels?</font></span></div><div></div><div id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6489"><font color="#000000"> </font></div><div class="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296signature" id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6490"><font color="#000000">Best regards,</font><div id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6491"><font color="#000000">Zhaleh </font></div><div id="m_-2313607517365199360yiv2770853120m_-3287041924317399296yui_3_16_0_ym19_1_1497682601476_6492"><font color="#000000"><br clear="none"></font></div></div></div></div></div><font color="#000000"><br clear="none">______________________________ _________________<br clear="none">
Eeglablist page: <a rel="nofollow" shape="rect" href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ eeglabmail.html</a><br clear="none">
To unsubscribe, send an empty email to <a rel="nofollow" shape="rect" href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn. ucsd.edu</a><br clear="none">
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a rel="nofollow" shape="rect" href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd. edu</a><br clear="none"></font></blockquote></div><br clear="none"></div></div></div></div><br><br></div>  </div> </div>  </div></div></div></div></div></blockquote></div><br></div>