<div dir="ltr">Dear Kumar,<div><br></div><div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><font color="#0000ff">> But I want  a to know one thing if I use your preprocessing pipeline,  I can I cite the webpage ?</font></div><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="font-family:arial,sans-serif">I don't think citing a website is valid in scientific communication. Check the journal's policy.</span><br></div></div><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="font-family:arial,sans-serif"><br></span></div><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><div style="font-family:arial,sans-serif"><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><font color="#0000ff">> Further, following your preprocessing pipeline, when I run <b>Tool > Interpolate electrodes, </b>it gives the following warning message, </font></div><div><blockquote style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><font color="#0000ff"><br></font></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><font color="#0000ff"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Warning: do not interpolate channels before running ICA</font><br></font></blockquote><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0000ff"><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div>Is it okay to proceed further ignoring this message ? </font></div></div></div><div dir="auto" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="font-family:arial,sans-serif"><br></span></div><div>ICA can 'usually' tell the right rank of the data, so I would say it's ok. If you have a concern, use 'pca', 16 if your number of channels BEFORE INTERPOLATION is 16 to explicitly tell ICA to use rank of 16.</div><div><br></div><div>Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 3, 2017 at 6:26 PM, Narendra Kumar <span dir="ltr"><<a href="mailto:narendra.linguistics@gmail.com" target="_blank">narendra.linguistics@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="auto"><div><div dir="ltr"><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">​Dear Makoto,</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Thanks for the reply. I won't disclose it anywhere. But I want  a to know one thing if I use your preprocessing pipeline,  I can I cite the webpage ?</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif" dir="auto"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif" dir="auto">Further, following your preprocessing pipeline, when I run <b>Tool > Interpolate electrodes, </b>it gives the following warning message, </div><div><blockquote style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Warning: do not interpolate channels before running ICA</font><br></div></blockquote><font face="arial, helvetica, sans-serif"><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div>Is it okay to proceed further ignoring this message ? </font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Kindly reply.</font></div><div dir="auto"><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div dir="auto"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Thanks,</font></div><div dir="auto"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Narendra</font></div></div><br><div class="gmail_extra"><div><div class="gmail-h5"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 3, 2017 at 12:12 PM, narendra karna <span dir="ltr"><<a href="mailto:narendra.kumar@iitrpr.ac.in" target="_blank">narendra.kumar@iitrpr.ac.in</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Dear Makoto,</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:sans-serif;font-size:12.8px">I am a basic level learner of EEGLAB toolbox. I can only do GUI based steps. </span>In your preprocessing pipeline, you mentioned</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div><div><blockquote style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:sans-serif;font-size:12.8px">There are reports that 1-Hz high-pass filter attenuates (or even 'distorts') low-frequency, so-called 'late slow waves' of event-related potential family, such as N400 or P600 (these names are paradigm dependent, of course). To avoid this problem, one can calculate ICA weight matrix and sphereing matrix with 1-Hz high-passed data, then apply it to 0.1-Hz high-passed data. This ICA matrices transfer can be done through EEGLAB GUI 'Edit' -> 'Dataset info'.</span><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:sans-serif;font-size:12.8px"><br></span></div></blockquote><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px">Here, can you explain how to perform this step wise (in a pipeline way) ? I'll be thankful to you for this.</span></font></div><div><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px"><br></span></font></div><div><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px">Thanks !</span></font></div><div><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px"><br></span></font></div><div><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px">Regards,</span></font></div><div><font color="#000000" face="sans-serif"><span style="font-size:12.8px">Narendra</span></font></div><div><span style="font-size:12.8px">Research Scholar</span></div><div class="gmail-m_-6429400938662807333m_1651580048081840355m_7903453241279918597gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px">Department of Humanities and Social Sciences</div><div style="font-size:12.8px">Indian Institute of Technology Ropar</div><div style="font-size:12.8px">Punjab, India - 140001 <br></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><br> <br></div></div></div></div>
</div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div></div></div><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888">-- <br></font></span><div class="gmail-m_-6429400938662807333m_1651580048081840355gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><img src="https://docs.google.com/uc?export=download&id=0ByXinAASca41Qmx2U3RFbkN3YVU&revid=0ByXinAASca41UEYwdW9TWXkwWGR0QWp2dHRNNDhTZm44TWlvPQ" width="96" height="41"></font></span><span class="gmail-"><br>Research Scholar<div>Department of Humanities and Social Sciences</div><div>Indian Institute of Technology Ropar</div><div>Punjab, India - 140001 <br></div><div><br></div><div> <br><br></div></span></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>
</div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>