<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:#333399">Hello Tyler, not sure if this helps: it's totally possible that eeg_lat2point removes or discounts 2 data points. It's unclear whether clean_windows can or should accomodate the changes made by eeg_lat2point. As this is unlikely to lead to a major issue, you could modify the sample_mask (inside the code) to take 2 less datapoints, although this might lead to several changes that one would need to make. Another option is to contact the developer Dr.Kothe? directly. Thanks very much for letting the list know when you have a solution, as it would benefit other users to learn from your experience.</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Dec 3, 2017 at 8:34 PM, Tyler Grummett <span dir="ltr"><<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au" target="_blank">tyler.grummett@flinders.edu.au</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="m_-5368009167973237611divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Dear EEGLAB</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Im having a great time using the clean_rawdata toolbox, however, I ran into a bug recently which is preventing me from using the function vis_artifacts. The bug occurs after Ive used clean_windows and try to compare the
 output data to the input data. The following error occurs:</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">Subscripted assignment dimension mismatch.</span></div>
<div><br>
</div>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">Error in vis_artifacts/expand_<wbr>rejections (line 334)</span></div>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">        tmpdata(EEG.etc.clean_channel_<wbr>mask,EEG.etc.clean_sample_<wbr>mask)</span></div>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">        = EEG.data;</span></div>
<div><br>
</div>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">Error in vis_artifacts (line 101)</span></div>
<div><span style="color:rgb(255,0,0)">    new = expand_rejections(to_<wbr>continuous(new));</span></div>
<br>
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Digging into the code I find out that the number of true logicals in EEG.etc.clean_sample_mask is equal to 2449098, whereas the number of data points in my 'cleaned' data is 2449096. Returning to the clean_windows function,
 I get the following warning:</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">Warning: eeg_lat2point(): Points out of range detected.</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">Points replaced with maximum value </span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">> In eeg_lat2point (line 101)</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">  In pop_select (line 534)</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">  In clean_windows (line 136)</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">  In clean_artifacts (line 226)</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">  In clean_rawdata (line 83)</span></div>
<div><span style="color:rgb(226,197,1)">  In mcgurk_clean_data (line 187) </span></div>
<br>
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">This suggests to me that eeg_lat2point may have removed some data points? Or do you think that clean_windows should accommodate for changes made my eeg_lat2point? Like the subject of this email suggests, I dont know where
 the bug is.</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">I can confirm that I am using clean_rawdata version 0.32</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Tyler</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<div id="m_-5368009167973237611Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-size:13px">*************************
<div style="font-family:Tahoma"><br>
</div>
<div><font face="Arial"><i>Tyler Grummett ( BBSc, BSc(Hons I))</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>PhD Candidate</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Brain Signals Laboratory</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Flinders University</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Rm 5A301</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Ext 66125</i></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/<wbr>eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.<wbr>ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.<wbr>edu</a><br></blockquote></div><br></div>