<div dir="auto">Dear list,<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">I have 10 EEG and 10 fMRI datasets recorded from 10 subjects. <span style="font-family:sans-serif"> I want to apply a statistic method, Canonical Correlation Analysis (CCA) on my EEG and fMRI data.</span></div><div dir="auto"><span style="font-family:sans-serif">To do so, I used the sliding window of 1 to</span> extract some features from all EEG channels for each dataset. The total number of windows in each channel is 80.</div><div dir="auto">For CCA, the rows of the matrix must be independent, so here subjects are independent observation and are arranged in a matrix as 10 rows and the columns are features from each window of each channel. </div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">My question is that are the windows from which I extarcted features are also independent from each other in EEG data or not? In other words, is the information of EEG windows (features) within each channel are independent from each other?</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">If they are independent, so I can put them as rows too, so the number of rows would be 10*80 (number of subjects * number of windows in each channel).</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">If they are dependent, the rows are subjects only.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Thank you very much in advance for your help.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Regards,</div><div dir="auto">Ali</div></div>