<div dir="ltr">Dear Edwige,<div><br></div><div>This typically happens when you have problems in your time-series data.</div><div><ol><li>Check if you have channels with zero or 1000000 uV data.</li><li>Check data stationarity in time domain.<br></li></ol><div>These checks can be done by using trimOutlier() plugin.</div></div><div><a href="https://sccn.ucsd.edu/wiki/TrimOutlier">https://sccn.ucsd.edu/wiki/TrimOutlier</a><br></div><div>I made this because there was no way to see all channels & all timepoints in a single figure. Download it via EEGLAB plugin manager and use it.</div><div><br></div><div>Most likely you have problem in your data. If you don't see the problem in using trimOutlier(), you should still go through all the time-series browsing by eye to find the problem. Send me the screenshot of trimOutlier() initial report plots if you don't see the problem. Edwige, this problem can be fixed for sure.</div><div><br></div><div>Makoto</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Fri, Jul 13, 2018 at 2:51 AM E. Sijyeniyo <<a href="mailto:e.sijyeniyo@student.rug.nl">e.sijyeniyo@student.rug.nl</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Dear Makoto, <div><br></div><div>Thank you for your answers! </div><div><br></div><div>However, I think you might not have fully understood what my problem was: </div><div><br></div><div>><span style="font-size:small;background-color:rgb(255,255,255)"><i>Good to discover the problem. Check what was wrong and confirm if ICA can be performed successfully.</i></span></div><div><span style="font-size:small;background-color:rgb(255,255,255)"><br></span></div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2">I have tried to run ICA how you suggested I should do it, so removing the eyes first and not having to click on ‘…channel’ in the Run ICA pop-up screen. I have recorded what happens if I try to run ICA for this participant. In the video, you can see how it looks like:</font></span></div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2"><a href="https://drive.google.com/file/d/16emh7TdllROu6s074nd6CacQKr5fMPto/view?usp=sharing" target="_blank">https://drive.google.com/file/d/16emh7TdllROu6s074nd6CacQKr5fMPto/view?usp=sharing</a> (you </font></span><font size="2">should watch until the end of the video, that’s where the error message pops up). </font></div><div><br></div><div><font size="2"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Here you can see the problem, so as soon as I type in the following in<i> Commandline options : ‘extended’, 1, ‘pca’ , [54] and then click ok </i>, it starts lowering the learning rate and then at some point when it gets to step 1, it has difficulty going on with further steps and eventually this error message pops up. I have tried to re-process the continuous data again, the same way I have done all my </span>other datasets, but for some reason, the error message only pops up with this particular dataset. So I can confirm that ICA cannot be performed successfully, why and how, I do not know because the preprocessing procedure is the same as for all my other participants where ICA was performed successfully.</font></div><div><font size="2"><br></font></div><div><div><i>>Yes, you should run ICA again to see if it works.</i></div><div><i>If ICA takes too long time, you can specify the ICA iteration number by using 'maxsteps', 20 to stop at 20th iteration for example.</i></div></div><div><i><br></i></div><div>Ok, I will run ICA again for these participants even though ICA was successful while icasphere and nbchan were NOT the same…</div><div><br></div><div>To summarise, as you can see in the video, the error pops up while ICA is being performed, so I do not know what happens for this particular participant.</div><div><br></div><div>Thank you once more for your time!!</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Edwige</div><div><br></div><div>P.S. I have shared the Google drive link in a separate email, in case the link in this email does not work accordingly.</div><div><div><br><blockquote type="cite"><div>Op 13 jul. 2018, om 02:48 heeft Makoto Miyakoshi <<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>> het volgende geschreven:</div><br class="gmail-m_-6777749872807163162Apple-interchange-newline"><div><div style="font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:small;background-color:rgb(255,255,255)">Good to discover the problem. Check what was wrong and confirm if ICA can be performed successfully.</div><br class="gmail-m_-6777749872807163162Apple-interchange-newline"></div></blockquote></div><br></div></div></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div></div>