<div dir="ltr">Thanks Makoto, David and Joaquin for the information. I see that it is a complex problem.<div>In our particular case we would need to filter the signal to monitor EEG activity during sleep experiment inside the MRI, so the real time processing must be good enough to stage sleep signal.</div><div>After the experiments we would process the signal offline using the whole signals and standard methods for GA and BCG artifcats. The only implementation that I know is the RecView software from Brain Products that allows to get a clean signal for monitoring but then you should process your data offline for better performance.</div><div><br></div><div>Thanks everybody for the help!</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">El jue., 6 sept. 2018 a las 15:18, Makoto Miyakoshi (<<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Agustin,<div><br></div><div>David is absolutely right. Gradient artifact needs to be subtracted from the channel signal to recover underlying EEG signal. The gradient artifact template is usually built by using multiple repetitions of the artifact itself. The waveform of the gradient artifact is determined by spatial location of the electrode and cables inside the scanner, so virtually there is no way to predict it beforehand. The simplest method to build such a template is to calculate event-related potential of the gradient artifact. This works only when the artifact is perfectly stationary, which is usually impossible due to subject's movement. There are various signal processing approaches, but there is no perfect solution for this.</div><div><br></div><div>Even if you are lucky enough to subtract gradient artifact well, you still need to do pretty much the same for ballistocardiogram which has lower amplitude than the gradient artifact but probably more tricky.</div><div><br></div><div>If you have a good calibration period from which you can build a nice template for both GA and BCG, AND an ideal subject who does not move at all (total <1mm across xyz throughout the scanning), online solution would work. After all, the difficulty here is subject's body movement inside the scanner. If your subject is an animal with its skull fixed to the base, such an online processing would work.</div><div><br></div><div>Makoto</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Mon, Sep 3, 2018 at 2:21 PM Agustín Solano <<a href="mailto:asolano@bioingenieria.edu.ar" target="_blank">asolano@bioingenieria.edu.ar</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi everybody. Does anyone know any open software for ONLINE removing gradient artifact in EEG during EEG-fMRI acquisition?<div>I think it like an alternative for the RecView software of Brain Products MR amplifiers.</div><div><br></div><div>Thanks!<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="m_-3826508879265443764m_2966897577847445192gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font size="2"><b>Bioing. Agustín Solano</b></font><br><font size="1">Instituto de Fisiología y Biofísica (IFIBIO) - Bernardo Houssay<br>Laboratorio de Fisiología de la Acción, Facultad de Medicina (UBA)<br>Paraguay 2155, Capital Federal<br>Buenos Aires, C1121ABG<br>Argentina<br>Tel: 54 11 5 950 9500 (2132)<br><a href="http://www.physiologyofactionlab.info" target="_blank">http://www.physiologyofactionlab.info</a></font><br></div></div></div></div></div></div>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="m_-3826508879265443764gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font size="2"><b>Bioing. Agustín Solano</b></font><br><font size="1">Instituto de Fisiología y Biofísica (IFIBIO) - Bernardo Houssay<br>Laboratorio de Fisiología de la Acción, Facultad de Medicina (UBA)<br>Paraguay 2155, Capital Federal<br>Buenos Aires, C1121ABG<br>Argentina<br>Tel: 54 11 5 950 9500 (2132)<br><a href="http://www.physiologyofactionlab.info" target="_blank">http://www.physiologyofactionlab.info</a></font><br></div></div></div></div>