<div dir="ltr"><font color="#000000">Hello<span class="gmail_default" style=""> Yadwinder </span>, <span class="gmail_default" style=""> brief notes below, best wishes. </span><br><br><br><br><br><br><span class="gmail_default" style=""> ************Notes for Yadwinder </span></font><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""> </span><br><span class="gmail_default" style=""> T</span>his topic has been discussed several times on eeglablist, try googling it eegalblist + your topic<br>regarding both baselining and epoch lengths, if you are just beginning your best bet is follow the methods from high-quality articles that use EEG or MEG and a paradigm similar to yours<span class="gmail_default" style=""> , and have epochs that are as long as the ones you have chosen to use. </span></font><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""><br></span></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style="">Other resource to check if you haven't already include the </span>tutorials <span class="gmail_default" style=""> and settings</span> from any EEG software (e.g., eeglab, fieldtrip, brainstorm, mne ptyhon, etc)<span class="gmail_default" style=""> . </span>EEG handbooks <span class="gmail_default" style=""> also </span>have discussions of usual baselin<span class="gmail_default" style=""> i </span>ng and epoching methods/choices. <br><br><span class="gmail_default" style=""> G</span>enerally, eeglab prefers common length epochs across single-subjects. <br>Recent versions of eegalb study may allow you to work with varying length epochs.</font><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""> Overall your question depends on whether your protocol is event-related or continuous.</span></font><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""> 48sec is a long time compared to usual epochs in EEG research (which are usually ~1 to 3 seconds long, and event-related). It may be best for you to have a way to cut these longer periods into smaller periods, perhaps related to various events during the 48 second period.</span></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style="">It is also unlikely that these 48s periods are without artifacts such as blinks or movement, so double check to see how you have cleaned your data, and whether you truly have many 48 sec that are clean of artifact. </span></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""><br></span></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style="">Also, if you are going to stay with the 48s periods, it's important that you have many epochs like this for each participant (~20 or 30 minimum).</span></font></div><div><font color="#000000"><span class="gmail_default" style=""><br></span></font></div><div><font color="#000000">For sanity checks and your initial review of the data patterns, do <span class="gmail_default" style=""> an initial</span> analysis using the shortest length epoch and use that as a length for all epochs.<br><br>Alternatively, make subclasses of epochs that are at different lengths (e.g., the 3, 5, and 10 s ones)<br><br>Alternatively, look at event-related activity time-locked NOT to the onset of the stimulis, but to the "response" of the participant, or to some other event.<br><br>regarding baselining, baselines in the literature range from -1000 ms to -100 ms, it depends on the paradigms. It also depends if you are looking at ERPs or ERSPs, or if the data is continuous. It also depends on the quality of the baseline period (is it clean, it is neutral, is it a valid baseline period relative to the task?)<br><br>Note that one can also baseline to the mean of the whole epoch, to a baseline gathered in a different or resting task, to an estimate across all-subjects, etc.. Check previous eeglablist discussions on this, some of which I've pasted below from a google search.<br><br><br><br>*****<span class="gmail_default" style=""> Below some</span> examples from google scholar discussing baselining effects<br>Tanner, D., Norton, J. J., Morgan-Short, K., & Luck, S. J. (2016). On high-pass filter artifacts (they’re real) and baseline correction (it’sa good idea) in ERP/ERMF analysis. Journal of neuroscience methods, 266, 166-170.<br><br>Schr, B. M. E., & Widmann, A. (2016). High-pass filters and baseline correction in M/EEG. cognition, 52(8), 997-1009.<br><br>Hu, L., Xiao, P., Zhang, Z. G., Mouraux, A., & Iannetti, G. D. (2014). Single-trial time–frequency analysis of electrocortical signals: Baseline correction and beyond. Neuroimage, 84, 876-887.<br><br><br><br></font><div class="gmail_default" style=""><font color="#000000">***below examples of google search output or eeglablist + baseline</font></div><font color="#000000"><br>Feb 25, 2017 - I usually baseline in the code and always make sure to save the baselined ... Jumana <jumana.ahmad at <a href="http://kcl.ac.uk">kcl.ac.uk</a>> wrote: > Dear EEGlab list, ...<br><br>[Eeglablist] ERSP baseline<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2006/001332.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2006/001332.html</a><br><br>Mar 16, 2006 - If my AD rate is 1000Hz, and my >baseline period is -1 to 0, will the last ... >eeglablistmailing list eeglablist at <a href="http://sccn.ucsd.edu">sccn.ucsd.edu</a> >Eeglablist page: ...<br><br>[Eeglablist] Baseline<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2016/010906.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2016/010906.html</a><br><br>Feb 5, 2016 - [Eeglablist] Baseline ... You can > also see what the usual baselines are in their tutorial data. ... More information about the eeglablist mailing list.<br><br>[Eeglablist] baseline correction<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2018/013941.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2018/013941.html</a><br><br>Aug 15, 2018 - Previous message: [Eeglablist] baseline correction; Next message: [Eeglablist] Batch ... say [-10 +10] from stimulus onset - that would be your baseline, and taking the average ... More information about the eeglablist mailing list.<br><br>[Eeglablist] Continuous data - baseline correction<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2016/010890.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2016/010890.html</a><br><br>Jan 31, 2016 - [Eeglablist] Continuous data - baseline correction ... On Mon, Jan 25, 2016 at 4:57 PM, Liz Chrastil <chrastil at <a href="http://bu.edu">bu.edu</a>> wrote: > Hello List ...<br><br>[Eeglablist] baseline removal and ICA - Swartz Center for ...<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/005003.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/005003.html</a><br><br>May 30, 2012 - [Eeglablist] baseline removal and ICA ... at <a href="http://sccn.ucsd.edu">sccn.ucsd.edu</a>" <eeglablist at <a href="http://sccn.ucsd.edu">sccn.ucsd.edu</a>> Enviado: Martes, 29 de mayo, 2012 4:53 P.M. Asunto: Re: [Eeglablist] baseline ... More information about the eeglablist mailing list.<br><br>[Eeglablist] When to select Additive Baseline in ERSP Study ...<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2018/013820.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2018/013820.html</a><br><br>Jul 18, 2018 - [Eeglablist] When to select Additive Baseline in ERSP Study Function? ... Van Benthem < kathy_vanbenthem at <a href="http://carleton.ca">carleton.ca</a>> wrote: > Dear List, ...<br><br>[Eeglablist] extract epochs without removing baseline<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/005964.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/005964.html</a><br><br>Dec 13, 2012 - [Eeglablist] extract epochs without removing baseline. Stephen ... Apologies if this has been answered before, but I could not find it in the > list.<br><br>[Eeglablist] time/frequency baseline length - Swartz Center for ...<br><br><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2006/001573.html">https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2006/001573.html</a><br><br>Oct 27, 2006 - Scott Makeig From: "Ayelet Landau" <ayeletlandau at <a href="http://berkeley.edu">berkeley.edu</a>> To: "EEGLab List" <eeglablist at <a href="http://sccn.ucsd.edu">sccn.ucsd.edu</a>> Date: Thu, 26 Oct 2006 ...<br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br><br></font><div class="gmail_quote"><br></div></div></div></div></div></div>