<div dir="ltr">Dear Omar,<div><br></div><div><p class="MsoNormal">&gt; 1) I understand it is important to specify the reference channel/s&nbsp; for the Biosemi data. But is it important to specify the reference channels during the import stage compared to after the data have been imported? (I ask because the import GUI points out that reference channel Indices are required for BIOSEMI &ndash; it&rsquo;s just not clear to me if this is referring specifically to the import stage).</p>

<p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">No, the re-reference process should be the same.</p><p class="MsoNormal">&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">&gt; 2)&nbsp; After referencing the dataset, the dataset gui displays the reference channels correctly. However, if I subsequently update the channel locations (using edit | channel locations, and selecting &quot;\eeglab13_1_1b\plugins\dipfit2.2\standard_BESA\standard-10-5-cap385.elp&quot; as the channel location file), the reference channels go back to &quot;unknown&quot;. As far as I can tell, the data array is not being affected, so is this just a dataset metadata bug?<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">Yes, I agree with you. That should be a metadata bug. I&#39;ll file it for you.</p><p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">&gt; 3) I assume it does not matter whether basic filtering for pre-processing purposes (e.g. get rid of low frequency drifts) is done before or after referencing. Is this correct?</p>

</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Yes. However, if you will use ICA, you want to re-reference after ICA so that you can avoid rank reduction for ICA.</div><div class="gmail_extra"><br></div>

<div class="gmail_extra">Makoto<br><br><div class="gmail_quote">2014-03-22 8:59 GMT-07:00 Omar Mian <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:omian88@gmail.com" target="_blank">omian88@gmail.com</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">

<div lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72"><div><p class="MsoNormal">I&rsquo;m new to EEGLAB and EEG data processing in general. I am getting started by working with some 40 channel Biosemi .bdf data files (32 scalp electrodes + 8 additional electrodes). I have a few questions that I&rsquo;d appreciate assistance with.<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">1) I understand it is important to specify the reference channel/s&nbsp; for the Biosemi data. But is it important to specify the reference channels during the import stage compared to after the data have been imported? (I ask because the import GUI points out that reference channel Indices are required for BIOSEMI &ndash; it&rsquo;s just not clear to me if this is referring specifically to the import stage). To work around the issue I raise in point 2 below, it seems to me that I&rsquo;ll need to reference after loading the channel locations rather than during import.<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">2)&nbsp; After referencing the dataset, the dataset gui displays the reference channels correctly. However, if I subsequently update the channel locations (using edit | channel locations, and selecting &quot;\eeglab13_1_1b\plugins\dipfit2.2\standard_BESA\standard-10-5-cap385.elp&quot; as the channel location file), the reference channels go back to &quot;unknown&quot;. As far as I can tell, the data array is not being affected, so is this just a dataset metadata bug?<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">3) I assume it does not matter whether basic filtering for pre-processing purposes (e.g. get rid of low frequency drifts) is done before or after referencing. Is this correct?<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">Thanks<span class=""><font color="#888888"><u></u><u></u></font></span></p><span class=""><font color="#888888"><p class="MsoNormal"><u></u>&nbsp;<u></u></p><p class="MsoNormal">

Omar<u></u><u></u></p></font></span></div></div><br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>

-- <br><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>
</div></div>