<div dir="ltr">Dear Haj,<div><br></div><div>&gt; The mean peak amplitude of the ICs is dramatically lower than channels! (there was no IC rejection).<br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">This is not the right way to make the comparison between IC and channel activities.</div>

<div class="gmail_extra">In channels, alpha is represented redundantly, while in the independent component space it is represented maximally independently from any other activities.</div><div class="gmail_extra"><br></div>

<div class="gmail_extra">You may want use &#39;pvaftopo&#39; plugin to see how scalp channel signals are explained by ICs in the sense of variance. In the bast case, 60-80% of variance of a single channel can be explained by a single IC (if the source and the channel are located closely, and the task used efficiently activate the source all the time...) If you do this process with band-pass filter at alpha range, you can obtain the measure of how much alpha at channels are contributed by an IC.</div>

<div class="gmail_extra"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Plugin_list_process">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Plugin_list_process</a><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra">

<br><div class="gmail_quote">2014-05-21 8:38 GMT-07:00 Haj Morez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:hajmorez@gmail.com" target="_blank">hajmorez@gmail.com</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">

<div dir="ltr"><div>I am using AMICA ICA for decomposing EEG signals and study behavior of the EEG signals before and after applying ICA.</div><div>At the moment I am trying  to compare spectral content of raw EEG signals, with spectral content of the ICA decomposition.</div>


<div>I am using the &quot;spectopo()&quot; function from EEGLAB, and calculate the peak amplitude at 10 Hz averaged over all channels. Then trying to compare it with peak amplitude at 10 Hz averaged over all components (ICs).</div>


<div>I noticed, there is a dramatic decay in the spectral content of the signal when ICA is applied. The mean peak amplitude of the ICs is dramatically lower than channels! (there was no IC rejection). </div><div>The 10 Hz peak amplitude averaged over channels is ranging between 20-50 dB, however it ranges between -20 to -5 dB when it is calculated over ICs.</div>


<div>I really appreciate it if you could help me to explain the reason why it happens.</div><div><br></div><div>P.S. I had same results when used EX-infomax ICA.</div><div><br></div><div>Kindest regards,</div><div>Haj</div>


</div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>

-- <br><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>
</div></div>