<p dir="ltr">Hi Rachel,</p>
<p dir="ltr">If by getting &quot;weights for the cluster&quot; you mean getting average ic weights for the cluster components - this is a bad idea. The ic weight maps can be diverse across  components within a cluster (even if estimated dipole positions are similar) and averaging across these is not meaningful (no subject has an average component; to keep the ic signal relevant you need to use ic weights obtained at the individual level).</p>

<p dir="ltr">I also recommend measure projection - you can google:<br>
eeglab measure projection toolbox</p>
<p dir="ltr">You will find egglab page describing the toolbox. See also the paper that is referenced there that introduces measure projection - the description of the method is very clear. </p>
<div class="gmail_quote">27 cze 2014 02:18 &quot;Cooper, Rachel&quot; &lt;<a href="mailto:rcoopea@essex.ac.uk">rcoopea@essex.ac.uk</a>&gt; napisał(a):<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi all,<br>
<br>
This is partly a theoretical question and partly a practical one. I have a study with 2 participant groups and 3 repeated measures factors. So far I have run ICA on my epoched data and then used cluster analysis. My problem is that the clusters which are most interesting (i.e., they look like relevant ERPs and contain the most ICs) contain lots of ICs from some participants and none from others. I assume this must be the case in any study with a between subjects factor.<br>

<br>
A suggestion from my PhD supervisor was to find the weights for the cluster and then apply these weights to the EEG data for every participant and every condition. That way I can compare these new component activations across my conditions/subjects knowing that the same IC component is being compared. Is it safe to do this theoretically?<br>

<br>
On a practical level, I have found the data used to plot the cluster scalp map in STUDY.cluster(clust).topo. However, I don&#39;t know how I would use this to apply cluster weights to the rest of my data as it is not a matrix of channels x ICs like the regular ICA weights. Is there another way to access the weights for a cluster?<br>

<br>
Any help is much appreciated and if you need more detail please let me know<br>
This is a fantastic list!<br>
<br>
Rachel<br>
<br>
Rachel Cooper<br>
PhD researcher<br>
Department of Psychology,<br>
University of Essex,<br>
Wivenhoe Park,<br>
Colchester,<br>
Essex,<br>
CO4 3SQ<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote></div>