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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Thanks Arno!&nbsp; I&#8217;m glad the plotting function is still accessible so that I can customize it for my own STUDY designs.&nbsp;
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">-Ann<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;"> Arnaud Delorme [mailto:arno@ucsd.edu]
<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, July 08, 2014 3:38 PM<br>
<b>To:</b> mmiyakoshi@ucsd.edu<br>
<b>Cc:</b> Eddins, Ann; Ramón Martinez; eeglablist<br>
<b>Subject:</b> Re: [Eeglablist] STUDY Cluster analyses and plotting<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<blockquote style="border:none;border-left:solid #CCCCCC 1.0pt;padding:0in 0in 0in 6.0pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">I have two questions regarding STUDY cluster analyses.&nbsp; First, I have created a STUDY, precomputed component measures, clustered components and now want to visualize a composite
 of the cluster results using &#8220;Plot Cluster Properties&#8221;; however, this button is not active in the GUI (i.e., grayed out).&nbsp; Is this option not available or can I access it via the command line?&nbsp;<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</blockquote>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">This function has been removed and is probably not coming back.&nbsp;<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">There were issues with plotting on some complex design. From the command line, try<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">std_propplot(STUDY, ALLEEG, 1);<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<div>
<div>
<blockquote style="border:none;border-left:solid #CCCCCC 1.0pt;padding:0in 0in 0in 6.0pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in;z-index:auto">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">If so, what function(s) do I need to call?&nbsp; Second, in analyzing the cluster results, I was wondering if the clusters are hierarchically ordered (i.e., after the parent cluster,
 does cluster 2 account for the most variance, followed by cluster 3, etc.) or should each cluster be evaluated independently?
<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</blockquote>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">There is no order to the clusters.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Best,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Arno<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
<br>
<o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<blockquote style="border:none;border-left:solid #CCCCCC 1.0pt;padding:0in 0in 0in 6.0pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in;z-index:auto">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">&nbsp;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Thanks!<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="color:#888888">Ann<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="color:#888888">&nbsp;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="color:#888888">&nbsp;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="color:#888888">&nbsp;<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
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</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
<br clear="all">
<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal">-- <o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
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