<html><head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8"><style>body { line-height: 1.5; }blockquote { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.5em; }div.foxdiv20140807112621160421 { }body { font-size: 10.5pt; font-family: 微软雅黑; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 1.5; }</style></head><body>
<div><span></span>Thank you. But I don't know when the detrend function is used (after run ICA)??And in my view, removing linear trend is equal to high-pass filter.</div>
<div><br></div><hr style="width: 210px; height: 1px;" color="#b5c4df" size="1" align="left">
<div><span>bjj2909102003</span></div>
<blockquote style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.5em;"><div>&nbsp;</div><div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm"><div style="PADDING-RIGHT: 8px; PADDING-LEFT: 8px; FONT-SIZE: 12px;FONT-FAMILY:tahoma;COLOR:#000000; BACKGROUND: #efefef; PADDING-BOTTOM: 8px; PADDING-TOP: 8px"><div><b>From:</b>&nbsp;<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au">Tyler Grummett</a></div><div><b>Date:</b>&nbsp;2014-08-07&nbsp;08:28</div><div><b>To:</b>&nbsp;<a href="mailto:bjj2909102003@163.com">bjj2909102003</a></div><div><b>CC:</b>&nbsp;<a href="mailto:marco.buiatti@gmail.com">Marco Buiatti</a>; <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist</a></div><div><b>Subject:</b>&nbsp;Re: [Eeglablist] ICA and eye blink component</div></div></div><div><div class="FoxDiv20140807112621160421">
<div>Just remember that if you band pass before ICA you can't do directional connectivity with the ICs.</div>
<div><br>
</div>
<div>I've found using SIFT's detrend function is a good alternative.</div>
<div><br>
</div>
<div>Good luck!<br>
<br>
Tyler</div>
<div><br>
On 7 Aug 2014, at 2:25 am, "bjj2909102003" &lt;<a href="mailto:bjj2909102003@163.com">bjj2909102003@163.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.5em;">
<div>
<div><span></span>Thank you for replying.</div>
<div>
<div>Actually, before I run ICA, I only filter the data by bandpass filter. It takes too much time to reject some&nbsp;<span style="font-size: 10.5pt; line-height: 1.5; background-color: window;">non-stereotypical artifacts, especially when I got many subjects(~100)
 data.</span></div>
</div>
<div><span style="font-size: 10.5pt; line-height: 1.5; background-color: window;">It is painful by visual inspection one by one. Your advice is good. Nonetheless, I believe ICA is robust in many situations.</span></div>
<div><span style="font-size: 10.5pt; line-height: 1.5; background-color: window;"><br>
</span></div>
<div><span style="font-size: 10.5pt; line-height: 1.5; background-color: window;">Thanks!</span></div>
<div><span style="font-size: 10.5pt; line-height: 1.5; background-color: window;">Booer</span></div>
<hr style="width: 210px; height: 1px;" color="#b5c4df" size="1" align="left">
<div><span>bjj2909102003</span></div>
<blockquote style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.5em;">
<div>&nbsp;</div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<div style="PADDING-RIGHT: 8px; PADDING-LEFT: 8px; FONT-SIZE: 12px;FONT-FAMILY:tahoma;COLOR:#000000; BACKGROUND: #efefef; PADDING-BOTTOM: 8px; PADDING-TOP: 8px">
<div><b>From:</b>&nbsp;<a href="mailto:marco.buiatti@gmail.com">Marco Buiatti</a></div>
<div><b>Date:</b>&nbsp;2014-08-06&nbsp;14:53</div>
<div><b>To:</b>&nbsp;<a href="mailto:bjj2909102003@163.com">bjj2909102003</a></div>
<div><b>CC:</b>&nbsp;<a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist</a></div>
<div><b>Subject:</b>&nbsp;Re: [Eeglablist] ICA and eye blink component</div>
</div>
</div>
<div>
<div class="FoxDiv20140806151010509273">
<div dir="ltr">Dear Booer,
<div><br>
</div>
<div>blinks are usually well identified by ICA. You may not easily identify blinks if:</div>
<div>1) your subject blinks really a few times -&gt; not enough for being captured by ICA, you may just discard the few epochs containing the blinks;</div>
<div>2) when your subject blinks, s/he moves so much that the relative artifact spreads over most sensors, and ICA is not able to capture it in a few clear components&nbsp;&nbsp;-&gt; Also in this case my advice is to &nbsp;discard the epochs containing the blinks;</div>
<div>3) you are computing the ICA on noisy data -&gt; reject segments of your data containing non-stereotypical artifacts and compute the ICA again.</div>
<div><br>
</div>
<div>ADJUST works well only if the ICA is computed on clean enough data.</div>
<div><br>
</div>
<div>Refs:</div>
<div>On blinks: Croft, R., &amp; Barry, R. (2000). Removal of ocular artifact from the EEG: A review. Clinical Neurophysiology, 30, 5–19.<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>On removing blinks with ICA: &nbsp;Jung, T.-P., et al. (2000). Removing electroencephalographic artifacts by blind source separation. Psychophysiology, 37, 163–178.</div>
<div><br>
</div>
<div>On removing blinks with ADJUST:&nbsp;Mognon A, Bruzzone L, Jovicich J, Buiatti M, ADJUST: An Automatic EEG artifact Detector based on the Joint Use of Spatial and Temporal features. Psychophysiology 48 (2), 229-240 (2011).</div>
<div><br>
</div>
<div>Hope this helps,</div>
<div><br>
</div>
<div>Marco</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On 5 August 2014 08:53, bjj2909102003 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:bjj2909102003@163.com" target="_blank">bjj2909102003@163.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.5em; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;">
<div>
<div><span></span>Hello,</div>
<div>I want to use ICA to reject eye blink. But for some subjects it is easy to find eye blink component, for others &nbsp;it is hard to find blink component even I use the plugin-ADJUST. So does ICA&nbsp;<span style="background-color:rgba(0,0,0,0)">extract</span>&nbsp;eye
 blink component without fail??</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks so much!</div>
<div>Booer</div>
<hr style="width:210px;min-height:1px" color="#b5c4df" size="1" align="left">
<div><br>
</div>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
Marco Buiatti, PhD<br>
<br>
CEA/DSV/I2BM / NeuroSpin<br>
INSERM U992 - Cognitive Neuroimaging Unit<br>
Bât 145 - Point Courrier 156<br>
Gif sur Yvette F-91191 &nbsp;FRANCE<br>
Ph: &nbsp;+33(0)169.08.65.21 <br>
Fax: +33(0)169.08.79.73<br>
E-mail: <a href="mailto:marco.buiatti@gmail.com" target="_blank">marco.buiatti@gmail.com</a><br>
<a href="http://www.unicog.org/pm/pmwiki.php/Main/MarcoBuiatti" target="_blank">http://www.unicog.org/pm/pmwiki.php/Main/MarcoBuiatti</a><br>
<br>
*********************************************** </div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.5em;">
<div><span>_______________________________________________</span><br>
<span>Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a></span><br>
<span>To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a></span><br>
<span>For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></span></div>
</blockquote>
<br>
<br>
__________ Information from ESET NOD32 Antivirus, version of virus signature database 10215 (20140806) __________<br>
<br>
The message was checked by ESET NOD32 Antivirus.<br>
<br>
<a href="http://www.eset.com">http://www.eset.com</a><br>
</div></div></blockquote>
</body></html>