<div dir="ltr">Dear Ramon,<div><br></div><div>Here is another report of a problem for you. Could you investigate it?</div><div><br></div><div>Makoto</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 6, 2014 at 4:34 PM, Iman M.Rezazadeh <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:irezazadeh@ucdavis.edu" target="_blank">irezazadeh@ucdavis.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72"><div><p class="MsoNormal">Hi, <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">
I have had a difficult time to run ‘<i>brainmovie3d’</i> function. Basically, I calculated the required input arguments for it using ‘<i>timef’</i> and ‘<i>newcrossf’</i> functions and then call <i>‘brainmovie3d’</i>:<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black"><u></u> <u></u></span></p><p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">[ersps{1,1},itcs{1,1},powbase,times,freqs] =  timef(icaact(1,:),2000,[0 2000],1000,0); </span><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:forestgreen">%     1st comp</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">[ersps{2,1},itcs{2,1},powbase,times,freqs] =  timef(icaact(2,:),2000,[0 2000],1000,0); </span><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:forestgreen">%     2nd comp</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">          </span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black"> [coh,mcoh,timesout,freqsout,cohboot,cohangles,allcoher,alltfX,alltfY]= newcrossf( icaact(1,:),icaact(2,:), 2000,[0 2000], 1000,0,</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:#a020f0">&#39;nfreqs&#39;</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">,256);  </span><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:forestgreen">%type&#39;, &#39;phasecoher&#39;, </span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">coh_cell={[] coh};  cohangles_cell={[] cohangles};</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;;color:black">brainmovie3d(ersps,itcs,coh_cell,cohangles_cell,times,[1:30]);</span><span style="font-size:12.0pt;font-family:&quot;Courier New&quot;"><u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><i> ‘brainmovie3d’</i> function goes  smoothly until it gets to the point that it wants to call ‘<i>dipplot’</i> function. The first input argument of ‘<i>dipplot’</i> is ‘<i>dipstruct’</i> which SHOULD have xyz coordinates of selected components. HOWEVER in ‘<i>brainmovie3d’</i> function and according to its Help, coordinates are  2-column array of [x y] coordinates of the selected components.  <u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Does anyone have any thoughts about this issue?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Best<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Iman<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">

<u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><b>-------------------------------------------------------------<u></u><u></u></b></p><p class="MsoNormal"><b>Iman M.Rezazadeh, Ph.D<u></u><u></u></b></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>

<p class="MsoNormal">Research Associate II <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Semel Intitute, UCLA , Los Angeles<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">&amp; Center for Mind and Brain, UC DAVIS, Davis<u></u><u></u></p>

<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">  <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></div></div></blockquote>

</div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>
</div>