<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body dir="auto">
<div>Hey makoto,</div>
<div><br>
</div>
<div>That would be great, currently I'm just turning that off (last argument from memory).</div>
<div><br>
</div>
<div>I've also asked the question of whether using the high pass filter in this function will interrupt connectivity measures. I looked up forward backward highpass filter, but didn't understand it, what does non causal mean in this respect?</div>
<div><br>
</div>
<div>Kind regards,</div>
<div><br>
</div>
<div>Tyler</div>
<div><br>
Sent from my iPhone</div>
<div><br>
On 1 Oct 2014, at 2:45 am, Makoto Miyakoshi &lt;<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>&gt; wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div dir="ltr">Dear Tyler,
<div><br>
</div>
<div>First of all, 99% of the credit should go to Christian Kothe. I just wrote a wrapper for EEGLAB.</div>
<div><br>
</div>
<div>&gt; Is it possible to use that function to get regions of time that are considered artefactual? Rather than it removing the data itself?<br>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
</div>
<div class="gmail_extra">Internally the indices of latencies are generated. For rejection, it usually uses pop_rejcont, but I know it does not work recently and also know that Christian prepared a workaround which usually works... if you want, I can talk to
 Christian to support to output the latencies in the EEGLAB pop_rejcont format (i.e. [start_latency end_latency]).</div>
<div class="gmail_extra"><br>
</div>
<div class="gmail_extra">Makoto</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Tue, Sep 30, 2014 at 3:32 AM, Tyler Grummett <span dir="ltr">
&lt;<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au" target="_blank">tyler.grummett@flinders.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="auto">
<div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)">Hello Makoto,</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)">Is it possible to use that function to get regions of time that are considered artefactual? Rather than it removing the data itself?</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)">I think the function pop_rejcont has that functionality. Otherwise its a stunning function!</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)"><br>
</span></div>
<div><span style="background-color:rgba(255,255,255,0)">Tyler</span></div>
<br>
Sent from my iPad</div>
<div>
<div class="h5">
<div><br>
On 30 Sep 2014, at 2:50 am, Makoto Miyakoshi &lt;<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>&gt; wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div dir="ltr">Dear Arun,
<div><br>
</div>
<div>The point in ASR 20 is to let ICA learn artifacts well but at the same time protect ICA from outliers in the raw data.</div>
<div><br>
</div>
<div>&gt; I have been using default values with good results. But some of our lab's meditation data were losing visible 'alpha' patterns with this.<br>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
</div>
<div class="gmail_extra">Right, it happened to me too. That's why I increased the threshold far higher.</div>
<div class="gmail_extra"><br>
</div>
<div class="gmail_extra">After all, you cannot completely separate and remove artifacts only. The merit of ASR is evaluated in a total SNR increase, and there is no guarantee that the signal will be absolutely protected e.g. if Method A removes 10 artifacts
 and 1 signal, and Method B removes 30 artifacts and 2 signal, Method B is better in total.</div>
<div class="gmail_extra"><br>
</div>
<div class="gmail_extra">Makoto</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Mon, Sep 29, 2014 at 9:37 AM, Arun Sasidharan <span dir="ltr">
&lt;<a href="mailto:arunsasi84@gmail.com" target="_blank">arunsasi84@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Dear Makoto,
<div>Thanks for the reply. I was wondering how such a large std value would be used.&nbsp;</div>
<div>I have been using default values with good results. But some of our lab's meditation data were losing visible 'alpha' patterns with this.</div>
<div>I will use this and give my feed back.</div>
<div>Once again thanks....&nbsp;</div>
</div>
<div>
<div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On 29 September 2014 21:39, Makoto Miyakoshi <span dir="ltr">
&lt;<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Dear Arun,
<div><br>
</div>
<div>Read the GUI carefully and you'll find one of the boxes says '... using ASR' in which the default value could be 4 or 5 but change it to 20.</div>
<div><br>
</div>
<div>Makoto</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">
<div>
<div>On Sun, Sep 28, 2014 at 2:24 AM, Arun Sasidharan <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:arunsasi84@gmail.com" target="_blank">arunsasi84@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
</div>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div>
<div>
<div dir="ltr">Dear Makoto,
<div>In the last email with this topic ('Methods of improving SNR'), you mentioned that ASR threshold of &quot;20&quot; produced good results. Could you kindly help me identify the parameter of clean_raw/clean_asr that I need to change to acheve this. &nbsp;</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks...&nbsp;<span><font color="#888888"><br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr"><font color="#999999">Dr Arun Sasidharan<br>
PhD Scholar &amp; Senior Research Fellow (ICMR) &nbsp;</font>
<div><font color="#999999">Dept of Neurophysiology &amp; Multi-modal Brain Image Analysis Laboratory (MBIAL)<br>
NIMHANS, Bangalore-560029, India.</font>
<div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><a href="http://nphy.weebly.com/arun-sasidharan.html" target="_blank">http://nphy.weebly.com/arun-sasidharan.html</a></span>
<div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><a href="http://mbial.weebly.com/arun-sasidharan.html" target="_blank">http://mbial.weebly.com/arun-sasidharan.html</a><br>
<a href="http://in.linkedin.com/pub/dr-arun-sasidharan/18/a15/352" target="_blank">http://in.linkedin.com/pub/dr-arun-sasidharan/18/a15/352</a><br>
<font color="#999999">Mob: <a href="tel:%2B91-9964923983" value="&#43;919964923983" target="_blank">
&#43;91-9964923983</a></font></span><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</font></span></div>
</div>
<br>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><span><font color="#888888"><br>
</font></span></blockquote>
</div>
<span><font color="#888888"><br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</font></span></div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr"><font color="#999999">Dr Arun Sasidharan<br>
PhD Scholar &amp; Senior Research Fellow (ICMR) &nbsp;</font>
<div><font color="#999999">Dept of Neurophysiology &amp; Multi-modal Brain Image Analysis Laboratory (MBIAL)<br>
NIMHANS, Bangalore-560029, India.</font>
<div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><a href="http://nphy.weebly.com/arun-sasidharan.html" target="_blank">http://nphy.weebly.com/arun-sasidharan.html</a></span>
<div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><a href="http://mbial.weebly.com/arun-sasidharan.html" target="_blank">http://mbial.weebly.com/arun-sasidharan.html</a><br>
<a href="http://in.linkedin.com/pub/dr-arun-sasidharan/18/a15/352" target="_blank">http://in.linkedin.com/pub/dr-arun-sasidharan/18/a15/352</a><br>
<font color="#999999">Mob: <a href="tel:%2B91-9964923983" value="&#43;919964923983" target="_blank">
&#43;91-9964923983</a></font></span><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite">
<div><span>_______________________________________________</span><br>
<span>Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a></span><br>
<span>To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a></span><br>
<span>For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></span></div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</body>
</html>