<div dir="ltr">Dear Ketherine,<div><br></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px">&gt; In the EEGLAB GUI it shows that there are 22 subjects, 1 condition per subject (so that&#39;s my between-subject factor), and 2 &#39;groups&#39; per subject (the within-subject factor).</span><br><div><br></div><div>You used the label &#39;group&#39; for the within-subject factor? </div></div><div><br></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px">&gt; With the study design set to include both independent variables, is it correct that the final dimension of &#39;erspdata&#39; is 11? Or should it be 22?</span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px">See below.</span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_05:_Component_Clustering_Tools">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_05:_Component_Clustering_Tools</a></span><br></div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:sans-serif;font-size:12.5714282989502px;line-height:19.0500011444092px">&gt; Clustering algorithms may not work well with measures having more than 10 to 20 dimensions.</span><span style="font-size:12.5714282989502px"> </span><br></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px">I recommend you use numbers so that the total number of dimensions are less than 20.</span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.5714282989502px">Makoto</span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 2, 2015 at 2:46 PM, Katherine R. Naish <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:naishek@mcmaster.ca" target="_blank">naishek@mcmaster.ca</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>I have a study design with one between-subject and one within-subject factor. There are 22 subjects in total, so there are 11 subjects per condition for the between-subject factor. In the EEGLAB GUI it shows that there are 22 subjects, 1 condition per subject (so that&#39;s my between-subject factor), and 2 &#39;groups&#39; per subject (the within-subject factor).</div><div><br></div><div>After precomputing the ERSP values using the GUI, I then use the following lines of code to produce/plot them:</div><div><br></div><div>STUDY=pop_erspparams(STUDY,&#39;timerange&#39;, [starttime endtime] ,&#39;freqrange&#39;, [lowfreq highfreq]);</div><div><br></div><div>[STUDY, erspdata, ersptimes, erspfreqs]=std_erspplot(STUDY, ALLEEG, &#39;channels&#39;,...)</div><div><br></div><div>With the study design set to include both independent variables, is it correct that the final dimension of &#39;erspdata&#39; is 11? Or should it be 22? <br><div><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div>Katherine</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Katherine R. Naish<br>Social Brain, Body, &amp; Action Lab<br>Department of Psychology, Neuroscience &amp; Behaviour<br>McMaster University<br>Hamilton, ON, CA<div><a href="tel:%28905%29%20525-9140%20ext.%2026755" value="+19055259140" target="_blank">(905) 525-9140 ext. 26755</a></div><div><a href="https://www.researchgate.net/profile/Katherine_Naish" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Katherine_Naish</a><br></div></div></div></div></div>
</font></span></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject &quot;set digest mime&quot; to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div>