<div dir="ltr">Hi all, <div><br></div><div>Selecting &quot;write files in matlab v6.5&quot; will get rid of &quot;empty scalp topography&quot; error when working with ICs in STUDY sets. </div><div><br></div><div>Deselecting eeglab option &quot;write files in matlab v6.5&quot; (thus saving in matlab v7.3) causes error in line 103 of <font face="monospace, monospace">std_readtopo</font>:</div><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><font face="arial, helvetica, sans-serif">Empty scalp topography file - also necessary for ERP polarity&#39; 10 &#39;Try recomputing scalp topographies for components</font></blockquote><div><br></div><div>This only occurs in linked .icatopo files. When a set has the same components as other sets in a STUDY, <font face="monospace, monospace">std_precomp</font> saves a &quot;linked&quot; .icatopo file to save space. The linked .icatopo is saved through <font face="monospace, monospace">std_savedat</font>. The only difference in saving linked .icatopo in v6.5 versus v7.3 is the order of the fields &quot;file&quot; and &quot;datafile&quot;, plus v6.5 is significantly smaller in size.</div><div><br></div><div>For whatever reason, saving in v7.3 causes read error in <font face="monospace, monospace">std_readtopo</font>, probably due to its subfunction <font face="monospace, monospace">correctfile</font><font face="arial, helvetica, sans-serif">. It also causes warnings that variables in lines 86-88 can&#39;t be found. </font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">This is on Ubuntu 14.4LTS &amp; Matlab 2014a. </font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">I will submit a bug report but adding this to d-list will make this Google-able for people who encounter this before it&#39;s patched.</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">--Kevin<br clear="all"></font><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif">--</font></div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif">Kevin Alastair M. Tan</font><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif">Lab Manager/Research Assistant<br></font><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif">Department of Psychology &amp; Center for the Neural Basis of Cognition</font></div><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif">Carnegie Mellon University</font></div><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font><div><div><font size="1" face="arial, helvetica, sans-serif"><a href="https://www.google.com/maps/place/40%C2%B026%2729.5%22N+79%C2%B056%2744.0%22W/@40.4414869,-79.9455701,61m/data=!3m1!1e3!4m2!3m1!1s0x0:0x0" target="_blank">Baker Hall 434</a> | <a href="mailto:kevintan@cmu.edu" target="_blank">kevintan@cmu.edu</a> | <a href="http://tarrlabwiki.cnbc.cmu.edu/index.php/KevinTan" target="_blank">tarrlab.org/kevintan</a></font></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>