<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Hello Maria, quick note below. Best wishes.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">**************************************************************************************</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Yes this should generally work in eeglab. Just properly create a study with your &quot;only&quot; 2 datasets.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Then compute/view plots of the differences between these two conditions.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Note there are also mutliple plugins (e.g. LIMO EEG) and an upcoming STUDY update that may be useful.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Alternatively, you should be able to subtract one set of data from the other,</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">and then feed the differenced data to the eeglab function of your choice.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">This would be in a script, where you have two EEG.data structures.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Then you should end up with one new EEG.data structure that is the difference.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">You have to determine how the difference is computed, channel-wise, time-wise, ERPs or continuous, etc...</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">You can also find previous answers on similar topics by googling eeglablist and your topic (e.g., difference, difference waves, difference topomap, etc..).</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div></div>